在临床实验室诊断中或作病原体分离培养、制备菌种过程中会因为样品的振荡、摇动、倾注、移液等操作，产生肉眼看不见的直径小于5／an的气溶胶和直径在5—10／an的液滴，由于颗粒非常小，能够很长时间在空气中漂浮，同时向较远距离扩散，可能产生吸入或交叉污染台面的其他材料。生物安全柜的作用就是有效减少气溶胶暴露所造成的实验室感染，保护操作人员、实验室环境，操作样品的生物安全。
1 生物安全柜的选择
根据对生物遏制程度的不同，目前设计的生物安全柜有 3种类型：I级、II级 (A1、A2、B1、B2型) 和III级。其中工级生物安全柜保护工作人员和环境，II级生物安全柜保护工作人员、环境和试样 (产品)，III级生物安全柜采用手套箱更严格地保护工作人员、环境和试样 (产品)。II级生物安全柜能基本满足临床实验室的工作需要 (对于不含有毒、放射性、挥发刺激性溶剂的样品的实验)。
2 生物安全柜的使用技巧
2．1 工作台的摆放原则：在工作台面上的实验操作应该按照从清洁区到污染区的方向进行。所有物品离前窗至少 5．08cm (2英寸)，所有污染性的操作尽量远离工作区域的后部。被污染的物品尽量不要进入干净区域，应放置在工作区域的后部。
2．2 火焰灯：生物安全柜内应避免使用火焰灯。一方面它会影响在工作中的安全柜内的层流，其次若操作中使用挥发性及易燃物质时会造成危险。应使用电热套或可抛的加热环。
2．3 溢出：当少量溢洒时，用吸收纸巾立即处理，并用消毒液擦洗台面及内部所有物品，若发生大量溢洒，安全柜内所有物品都应进行表面消毒并拿出安全柜，在确保排水阀关闭后，将消毒液倒在工作台面上，使液体以通过格栅流到排水盘上。
2．4 清洁和消毒：工作完毕后，用漂白粉或 70％酒精消毒台面和内壁，若用腐蚀性的化学剂消毒后，还应用灭菌水再擦洗。关机前安全柜继续开机 2—3 min吹扫工作区的污染物。定期清洁工作面下面的区域。
2．5 警报：生物安全柜有发出警报的功能。前窗高度警报，表明操作者将窗框移到一个不合适的位置，纠正后警报消除。送风或排风警报，提示压差损失达到预置值。调整压差损失后警报消除。